ИСТИНА

Cтруктура спиральных вирусов растений часто остается неизвестной, что связано с трудностью исследования ее классическими методами с высоким разрешением, такими как рентгеноструктурный анализ, криоэлектронная микроскопия и высоким содержанием в них подвижных неупорядоченных фрагментов. Структура вирусов довольно давно исследуется с помощью тритиевой планиграфии (ТП), которая стала ценным подспорьем к существующим физико-химическим методам [1]. Метод ТП основан на замене водорода на тритий в стерически доступных углеводородных участках при бомбардировке объектов потоком атомарного трития. Анализ распределения тритиевой метки на уровне аминокислотных остатков по длине макромолекулы детализирует структуру поверхности макромолекул и их комплексов. Объединение данных, полученных методом ТП, с результатами теоретических предсказаний структуры белка и разработанного нами имитационного алгоритма позволяет предложить модели структуры белка оболочки и вириона для тобамо-, поти- и потексвирусов. Мы предложили алгоритм определения ориентации субъединиц Х-вируса картофеля и уточнения координат атомов аминокислот в вирионе с помощью ТП. Алгоритм заключается в: 1) компьютерном моделировании бомбардировки вируса изотропным потоком атомов трития и 2) определении ориентации субъединиц в вирусах на основании сопоставления данных ТП и пространственных ограничений при сборке субъединиц в спиральный чехол вируса. Недавние исследования проведены на сферических частицах вируса табачной мозаики, полученных путем термической перестройки. Впервые получена информация о стерической доступности аминокислот на поверхности этих частиц и определены участки изменения структуры по сравнению с исходным вирусом [2]. Работа поддержана грантом РФФИ (18-04-00525) и финансированием ФИЦ ИХФ РАН (0082-2014-0001, № АААА-А17-117040610310-6)