ИСТИНА

Данные, получаемые путём окрашивания и микроскопии образов целого мозга, изучают путём автоматического вписывания образцов мозга в атлас и обнаружения меченых клеток в областях мозга. Однако математический аппарат, который позволял бы осуществлять, с одной стороны, точный автоматизированный количественный анализ активных клеток, а, с другой стороны, позволял бы сопоставлять полученную информацию о числе клеток во всем мозге с его функциональной анатомией, в настоящий момент недостаточно развит. Для решения этой проблемы был разработан DOGHOUSE – метод изучения пространственно-временной динамики активности целого мозга. Он состоит из двух компонент. CORGI – алгоритм вписывания образцов мозга в пространстве и их синхронизации во времени, который преодолевает различия между непохожими образцами мозга. DALMATIAN – алгоритм обнаружения клеток в образцах целого мозга, позволяющий автоматически идентифицировать клетки даже в сложных случаях, когда они плотно упакованы относительно друг друга. Наш метод был апробирован на образцах мозга взрослых и развивающихся мышей и показал характеристики, соответствующие или превышающие имеющиеся на тестовых выборках данных. Предложенный метод автоматизирует такие задачи как сравнение групп животных и мониторинг развития мозга. Все компоненты метода находятся в открытом доступе.